PHP二次开发主要通过以下几种方式来赚钱：

1、开发插件和模板：针对已有的内容管理系统（如Discuz、WordPress等），开发插件或主题模板，然后通过销售这些插件或模板来盈利。

2、定制开发和二次开发：根据客户的具体需求，进行网站的定制开发或对现有系统进行二次开发，从而收取开发费用。

3、提供API服务：开发API接口，并向其他开发者或企业出售API的使用权，或者根据使用量收费（例如按每月的请求次数收费）。

4、接受外包项目：承接其他公司或个人的PHP开发项目，通过完成项目来获得报酬。

5、网站优化和推广：为客户提供网站优化和推广服务，帮助他们提升网站的性能和流量，从而获得收入。

6、增值服务和售后支持：在提供基础开发服务后，还可以提供额外的增值服务和售后支持，以增加收入来源。

这些方法可以根据个人或团队的实际情况进行选择和组合，以实现盈利。